Identification of K-tolerance regulatory modules in time series gene expression data using a biclustering algorithm
Conference proceedings article
ผู้เขียน/บรรณาธิการ
กลุ่มสาขาการวิจัยเชิงกลยุทธ์
ไม่พบข้อมูลที่เกี่ยวข้อง
รายละเอียดสำหรับงานพิมพ์
รายชื่อผู้แต่ง: Phukhachee T., Maneewongvatana S.
ผู้เผยแพร่: Springer
ปีที่เผยแพร่ (ค.ศ.): 2013
Volume number: 8210 LNCS
หน้าแรก: 146
หน้าสุดท้าย: 155
จำนวนหน้า: 10
ISBN: 9783319027494
นอก: 0302-9743
ภาษา: English-Great Britain (EN-GB)
บทคัดย่อ
Nowadays, biclustering problem is still an intractable problem. But in time series expression data, the clusters can be limited those with contiguous columns. This restriction makes biclustering problem to be tractable problem. However existing contiguous column biclustering algorithm can only find the biclusters which have the same value for each column in biclusters without error tolerance. This characteristic leads the algorithm to overlook some patterns in its clustering process. We propose a suffix tree based algorithm that allows biclusters to have inconsistencies in at most k contiguous column. This can reveals previously undiscoverable biclusters. Our algorithm still has tractable run time with this additional feature. ฉ Springer International Publishing 2013.
คำสำคัญ
Biclustering, Error tolerance, Regulatory modules, Suffix tree, Time series gene expression data
ติดต่อสอบถามเพิ่มเติมได้ที่