A model of yeast cell-cycle regulation based on a standard component modeling strategy for protein regulatory networks
บทความในวารสาร
ผู้เขียน/บรรณาธิการ
กลุ่มสาขาการวิจัยเชิงกลยุทธ์
ไม่พบข้อมูลที่เกี่ยวข้อง
รายละเอียดสำหรับงานพิมพ์
รายชื่อผู้แต่ง: Laomettachit T., Chen K.C., Baumann W.T., Tyson J.J.
ผู้เผยแพร่: Public Library of Science
ปีที่เผยแพร่ (ค.ศ.): 2016
วารสาร: PLoS ONE (1932-6203)
Volume number: 11
Issue number: 5
นอก: 1932-6203
eISSN: 1932-6203
ภาษา: English-Great Britain (EN-GB)
ดูในเว็บของวิทยาศาสตร์ | ดูบนเว็บไซต์ของสำนักพิมพ์ | บทความในเว็บของวิทยาศาสตร์
บทคัดย่อ
To understand the molecular mechanisms that regulate cell cycle progression in eukaryotes, a variety of mathematical modeling approaches have been employed, ranging from Boolean networks and differential equations to stochastic simulations. Each approach has its own characteristic strengths and weaknesses. In this paper, we propose a "standard component" modeling strategy that combines advantageous features of Boolean networks, differential equations and stochastic simulations in a framework that acknowledges the typical sorts of reactions found in protein regulatory networks. Applying this strategy to a comprehensive mechanism of the budding yeast cell cycle, we illustrate the potential value of standard component modeling. The deterministic version of our model reproduces the phenotypic properties of wild-type cells and of 125 mutant strains. The stochastic version of our model reproduces the cell-to-cell variability of wild-type cells and the partial viability of the CLB2-dbฤ clb5ฤ mutant strain. Our simulations show that mathematical modeling with "standard components" can capture in quantitative detail many essential properties of cell cycle control in budding yeast. ฉ 2016 Laomettachit et al. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.
คำสำคัญ
ไม่พบข้อมูลที่เกี่ยวข้อง
ติดต่อสอบถามเพิ่มเติมได้ที่