Identification and detection of chili anthracnose using three new species-specific PCR primers
บทความในวารสาร
ผู้เขียน/บรรณาธิการ
กลุ่มสาขาการวิจัยเชิงกลยุทธ์
รายละเอียดสำหรับงานพิมพ์
รายชื่อผู้แต่ง: Osman Abdelrazig, Amir; Suwannarat, Sawita; Rijiravanich, Patsamon; Surareungchai, Werasak;
ผู้เผยแพร่: Springer
ปีที่เผยแพร่ (ค.ศ.): 2020
ชื่อย่อของวารสาร: Eur J Plant Pathol
Volume number: 158
Issue number: 2
หน้าแรก: 571
หน้าสุดท้าย: 582
จำนวนหน้า: 12
นอก: 0929-1873
eISSN: 1573-8469
ภาษา: English-Great Britain (EN-GB)
ดูในเว็บของวิทยาศาสตร์ | ดูบนเว็บไซต์ของสำนักพิมพ์ | บทความในเว็บของวิทยาศาสตร์
บทคัดย่อ
Three new species-specific primer sets were designed to detect C. truncatum, C. gloeosporioides species complex, and C. scovillei, which were reported as the cause of chili anthracnose disease. These new primers were designed based on the sequence data of the nuclear ribosomal DNA (rDNA) region to amplify and identify short size target DNA (<200 bp). The short size target DNA is more efficient for DNA hybridization, and will improve the sensitivity and specificity of DNA assay. The amplicon size obtained for C. gloeosporioides species complex, C. truncatum, and C. scovillei, was 66, 112, and 168 bp, respectively. Each primer set could identify its specific species of Colletotrichum as confirmed by the absence of PCR product with DNA of two other Colletotrichum species and DNA from different fungal genera, indicating high specificity. The sensitivity test was employed, and the results showed that these new primer sets could strongly amplify DNA at the concentration in femto- to picogram levels. Furthermore, these primer sets can be used to amplify and identify Colletotrichum species DNA directly from infected seeds and fruit tissue. The short PCR products obtained by the new primers have the potential to improve the sensitivity in DNA biosensors applications. © 2020, Koninklijke Nederlandse Planteziektenkundige Vereniging.
คำสำคัญ
anthracnose, Colletotrichum Chili, Species-specific primers
ติดต่อสอบถามเพิ่มเติมได้ที่