Reconstruction of starch biosynthesis pathway in cassava using comparative genomic approach
Conference proceedings article
ผู้เขียน/บรรณาธิการ
กลุ่มสาขาการวิจัยเชิงกลยุทธ์
ไม่พบข้อมูลที่เกี่ยวข้อง
รายละเอียดสำหรับงานพิมพ์
รายชื่อผู้แต่ง: Rongsirikul O., Saithong T., Kalapanulak S., Meechai A., Cheevadhanarak S., Netrphan S., Suksangpanomrung M.
ผู้เผยแพร่: Springer Verlag (Germany): Computer Proceedings
ปีที่เผยแพร่ (ค.ศ.): 2010
Volume number: 115 CCIS
หน้าแรก: 118
หน้าสุดท้าย: 129
จำนวนหน้า: 12
ISBN: 3642167497; 9783642167492
นอก: 1865-0929
ภาษา: English-Great Britain (EN-GB)
ดูในเว็บของวิทยาศาสตร์ | ดูบนเว็บไซต์ของสำนักพิมพ์ | บทความในเว็บของวิทยาศาสตร์
บทคัดย่อ
Cassava is one of the most attractive crops nowadays because it can produce and accumulate large amount of starch in its roots. Cassava starch is widely used as food, feed and raw materials for biochemical industries. Due to the increasing demand of cassava starch, the starch biosynthesis pathway is thus of interest for metabolic engineering, aiming at strain improvement. However, the uncertainties in the metabolic pathway of starch biosynthesis in cassava retard the rate of achievement. Availability of recently released cassava genome motivates us to reconstruct the starch biosynthesis pathway in cassava using comparative genomic approach. Here, nucleotide sequences of the template plants (i.e. Arabidopsis and potato) were compared with the sequence of cassava collected from three sources: Phytozome (genomic sequence), Cassava full-length cDNA and Cassava genome (ESTs) databases. The metabolic pathway of approximately 34 enzymes was constructed, including pathway from sucrose metabolism to amylose and amylopectin synthesis. The resulting pathway is a good initial point toward the complete pathway reconstruction. ฉ 2010 Springer-Verlag Berlin Heidelberg.
คำสำคัญ
Comparative genomic approach
ติดต่อสอบถามเพิ่มเติมได้ที่