Selection of reference genes for quantitative real-time PCR in postharvest tomatoes (Lycopersicon esculentum) treated by continuous low-voltage direct current electricity to increase secondary metabolites
บทความในวารสาร
ผู้เขียน/บรรณาธิการ
กลุ่มสาขาการวิจัยเชิงกลยุทธ์
ไม่พบข้อมูลที่เกี่ยวข้อง
รายละเอียดสำหรับงานพิมพ์
รายชื่อผู้แต่ง: Leelatanawit R., Saetung T., Phuengwas S., Karoonuthaisiri N., Devahastin S.
ผู้เผยแพร่: Wiley
ปีที่เผยแพร่ (ค.ศ.): 2017
วารสาร: International Journal of Food Science + Technology (0950-5423)
Volume number: 52
Issue number: 9
หน้าแรก: 1942
หน้าสุดท้าย: 1950
จำนวนหน้า: 9
นอก: 0950-5423
eISSN: 1365-2621
ภาษา: English-Great Britain (EN-GB)
ดูในเว็บของวิทยาศาสตร์ | ดูบนเว็บไซต์ของสำนักพิมพ์ | บทความในเว็บของวิทยาศาสตร์
บทคัดย่อ
Quantitative real-time PCR (RT-qPCR) is often used for gene expression analysis to reveal molecular mechanism of how stresses can enhance the secondary metabolites production. For RT-qPCR to be valid, robust reference genes are required. This study validated nine candidate genes as reference genes using BestKeeper, NormFinder and geNorm methods in RT-qPCR analysis of postharvest tomatoes subjected to electricity-induced stress. The most stable genes as indicated by each method were EF-1α by BestKeeper; CAC by NormFinder; and PP2Acs/TIP41 by geNorm. Due to the inconsistency in the ranking of the candidate genes by the three methods, the pairwise variation from geNorm analysis was used to calculate the minimum numbers of reference genes for an accurate normalisation and revealed that a combination of PP2Acs and TIP41 was an optimum. This reference gene combination was further validated for their stability in RT-qPCR analysis of four carotenoid-related genes, and more reliable expression levels were obtained. © 2017 Institute of Food Science and Technology
คำสำคัญ
Electric treatment, housekeeping genes, internal control, Lycopersicon esculentum, quantitative real-time PCR, reference genes, tomatoes
ติดต่อสอบถามเพิ่มเติมได้ที่